Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms