Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCOLN3Q8TDD5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCOLN3Q8TDD5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms