Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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