Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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