Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX2Q13950 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms