Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPL2Q05D32 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms