Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms