Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms