Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFNP31947 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFNP31947 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFNP31947 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SFNP31947 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFNP31947 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms