Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms