Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPI1P17947 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPI1P17947 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPI1P17947 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms