Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms