Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS56P0CW18 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms