Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERCC1P07992 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERCC1P07992 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERCC1P07992 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERCC1P07992 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms