Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1AO95602 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms