Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JRKO75564 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JRKO75564 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JRKO75564 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms