Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DENRO43583 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DENRO43583 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DENRO43583 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DENRO43583 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DENRO43583 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DENRO43583 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DENRO43583 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms