Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms