Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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