Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC23IPQ9Y6Y8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC23IPQ9Y6Y8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC23IPQ9Y6Y8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms