Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP20Q9Y6A4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP20Q9Y6A4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP20Q9Y6A4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP20Q9Y6A4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms