Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGA8Q9Y5G5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGA8Q9Y5G5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms