Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCDHGB5Q9Y5G0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB5Q9Y5G0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB5Q9Y5G0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB5Q9Y5G0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 491.8 ms