Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Y9

LSM5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM5Q9Y4Y9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM5Q9Y4Y9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSM5Q9Y4Y9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM5Q9Y4Y9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM5Q9Y4Y9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms