Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C5

CHST2, Carbohydrate sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST2Q9Y4C5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST2Q9Y4C5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST2Q9Y4C5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST2Q9Y4C5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST2Q9Y4C5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST2Q9Y4C5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST2Q9Y4C5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms