Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SALL2Q9Y467 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SALL2Q9Y467 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SALL2Q9Y467 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SALL2Q9Y467 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms