Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMED3Q9Y3Q3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED3Q9Y3Q3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED3Q9Y3Q3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED3Q9Y3Q3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms