Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COQ4Q9Y3A0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ4Q9Y3A0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COQ4Q9Y3A0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COQ4Q9Y3A0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms