Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR55Q9Y2T6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR55Q9Y2T6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPR55Q9Y2T6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms