Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A6Q9Y2P4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC27A6Q9Y2P4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms