Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMPQ9Y244 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMPQ9Y244 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMPQ9Y244 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMPQ9Y244 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMPQ9Y244 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMPQ9Y244 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POMPQ9Y244 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMPQ9Y244 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms