Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRAK1Q9UPV9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRAK1Q9UPV9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAK1Q9UPV9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRAK1Q9UPV9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 372 ms