Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SETD1BQ9UPS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SETD1BQ9UPS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SETD1BQ9UPS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1BQ9UPS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms