Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA7Q9UN72 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA7Q9UN72 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA7Q9UN72 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA7Q9UN72 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA7Q9UN72 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCDHA7Q9UN72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms