Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNRF3Q9ULT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNRF3Q9ULT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNRF3Q9ULT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNRF3Q9ULT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNRF3Q9ULT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNRF3Q9ULT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms