Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRFN2Q9ULH4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRFN2Q9ULH4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRFN2Q9ULH4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms