Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFAP45Q9UL16 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP45Q9UL16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms