Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM4Q9UKN5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRDM4Q9UKN5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms