Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCNL1Q9UK58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNL1Q9UK58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCNL1Q9UK58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCNL1Q9UK58 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCNL1Q9UK58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms