Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf18Q9UK00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf18Q9UK00 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C3orf18Q9UK00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms