Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCTN4Q9UJW0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCTN4Q9UJW0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCTN4Q9UJW0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms