Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SCN11AQ9UI33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN11AQ9UI33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN11AQ9UI33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms