Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNAL1Q9UBT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNAL1Q9UBT7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNAL1Q9UBT7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms