Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC17A6Q9P2U8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms