Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCN3Q9P1Z3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN3Q9P1Z3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN3Q9P1Z3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms