Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXXC1Q9P0U4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXXC1Q9P0U4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXXC1Q9P0U4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXXC1Q9P0U4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms