Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFY2Q9P0M6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2AFY2Q9P0M6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFY2Q9P0M6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms