Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSRB1Q9NZV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MSRB1Q9NZV6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms