Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD3Q9NZN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD3Q9NZN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms