Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USE1Q9NZ43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USE1Q9NZ43 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USE1Q9NZ43 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USE1Q9NZ43 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms